Kluczowa rola Aaliyah przekazana żonie Willa Smitha. Rok Matrixa

Mocny wycisk dostała również Jada Pinkett-Smith, żona Willa Smitha, która dołączyła do obsady po wakacjach w 2001 roku. Zastąpiła ona zmarłą w wyniku katastrofy lotniczej Aaliyahę i wcieliła się w rolę Niobe, kapitana statku Logos. Jada dołączyła do obsady niespodziewanie i dowiedziała się o angażu kilka tygodni po narodzinach swojego kolejnego dziecka. Ponieważ Niobe jest silną i umięśnioną kobietą znającą się na profesji żołnierza, Jada musiała bardzo szybko dojść do formy sprzed ciąży, a później ćwiczyć jeszcze ciężej, aby przypominać Niobe z wizji braci Wachowskich. Co prawda rola Niobe w Reaktywacji i Rewelacjach nie jest specjalnie duża, ale jest ona kluczową postacią gry komputerowej Enter The Matrix, która rozwija wątki niedopowiedziane w filmie – jej misją jest dotarcie do Klucznika, odebraniu od niego klucza i dostarczenie go Neo nim upadnie Zion – ostatnie miasto ludzi w prawdziwym świecie. Film skupia się bardziej na samym Neo, w przeciwieństwie do gry, w której główne skrzypce grać będzie właśnie Niobe. Właśnie dla potrzeb gry nakręcono mnóstwo scen z Jadą, których tylko niewielka część znajdzie się w Reaktywacji.

Więcej psychologii i filozofii

Od samego początku Reaktywacji Neo będzie nękany refleksjami na temat swojego wyboru i przeznaczenia, którego realizacji się podjął. Będzie też mieć wizje, napawające go niepewnością wobec siebie i swoich bliskich, a w szczególności Trinity, która w nich umiera. Wybór był słuszny, ale Neo wcale nie jest przekonany, czy zdoła podołać brzemieniu które musi teraz dźwigać – co będzie jeśli zawiedzie? Zion upadnie i ludzkość przegra. System wartości Morpheusa również zostanie zachwiany. Wypełnił on swoją misję – odnalazł Wybrańca, ale konsekwencje tego zadania ujawnią przed nim prawdy, których się nie spodziewał i które wstrząsnął wszystkim w co wierzył do tej pory. Także Agent Smith, obecnie wygnaniec działający poza poleceniami Matrixa, będzie musiał zmierzyć się ze swoimi ideałami. Nadal uważa ludzi za zarazę i pomimo, że zawiódł maszyny to zbuntował się przeciwko swojej kasacji i postanowił na własną rękę wykonać swoją misję. W ten sposób stał się samodzielny i bardziej zbliżył się do ludzi, których tak bardzo nienawidzi. Smith zmierzy się ze swoją nabytą ludzką naturą, która pomimo, że jest dla niego odrażająca, jednocześnie go podnieca i motywuje do dalszych – jeszcze bardziej wyrachowanych działań. Dzięki swojemu wyzwoleniu spod jarzma Matrixa Smith sprawił sobie swoistego „Service Packa”, dzięki któremu może teraz zniewalać postacie z Matrixa i przeistaczać je w swoje klony. Właśnie dzięki temu ulepszeniu zaatakuje on Neo wraz ze swoimi 99 kopiami. Reaktywacja będzie o wiele bardziej psychologiczna od Matrixa. Bohaterowie będą stawiani w sytuacjach, które zachwieją ich ideałami i będą musieli się odnaleźć w nowych realiach, dzięki którym postacie przez cały film będą się rozwijać. Producenci zapowiadają, że nie będzie już kontrastowego podziału na dobro i zło, czy biel i czerń, przez co film będzie jeszcze bardziej emocjonujący.